15.07.1979 tarihinde Gümrük ve Tekel Bakanlığı Gümrük Kontrolörlüğü sınavını kazanarak gümrük kontrolörü, 1981 yılında Gümrük ve Tekel Bakanlığında Gümrük Müfettiş Yardımcısı sınavını kazanarak Gümrük ve Tekel Bakanlığında Gümrük Müfettiş Yardımcısı olarak çalışmaya başlayan Cafer Şahin Maliye ve Gümrük Bakanlığında Teftiş Kurulunda Müfettişlik, Başmüfettişlik ve 1988 yılında 1 yıl süreyle İngiltere’de gümrük ve dış ticaret konularında inceleme ve araştırmalarda bulunduktan sonra 1992-1994 yıllarında Maliye ve Gümrük Bakanlığı Teftiş Kurulu Başkanlığı Başkan yardımcılığı ve Başbakanlık Gümrük Müsteşarlığı Teftiş Kurulu Başkan Yardımcılığı, 1995-1997 yıllarında Başbakanlık Gümrük Müsteşarlığı Teftiş Kurulu Başkanlığı İstanbul grup başkanlığı, 1996 yılında Hollanda ’daki Gümrük Muhafazanın yapısı, yetkileri ve çalışmaları hakkında inceleme, 2005 yılında Londra’da İngiltere Gümrük İdarelerinde yolcu işlemleri ve yolcu işlemlerinin denetimi, kontrolü ve risk analizleri 2011 yılında Gümrük ve Ticaret Bakanlığı Gümrük ve Ticaret Başmüfettişliği yapmış, 2018 yılında emekli olmuştur.

Gümrük Müşaviri, YMM ve Bağımsız Denetçi belgesi sahibi olarak Gümrük ve Dış Ticaret konularında EHŞ Hukuk ve Danışmanlık bünyesinde danışmanlık yapmaktadır. İngilizce bilmektedir.